02/02/2023
Vous développez des nouveaux composés thérapeutiques et vous n’arrivez pas à identifier sa/ses cibles avec vos données protéomiques ?
Plus généralement, vous utilisez la protéomique et vous n’arrivez pas à donner du sens/de la cohérence à vos résultats ?
À chaque problème sa solution et dans ce cas, la solution c’est InOPERA !
InOPERA est une solution logicielle unique capable notamment :
• D’explorer la complexité biologique
• De traduire les gènes inter-espèces
• De faire des analyses individuelles et non-comparatives
Comme vous l’avez peut-être compris, en marge de notre activité dans le domaine de l'habitat, nous intervenons parfois sur des problématiques pointues qui nécessitent des compétences spécifiques, car chez Method In The Madness nous relevons les défis.
Nous accompagnons depuis plus de deux ans la société Inoviem Scientific dans le développement d’InOPERA. InOPERA est une solution logicielle unique et innovante spécialisée dans l’analyse des protéines et des marqueurs biologiques durant les phases de développement de nouveaux traitements pharmaceutiques.
Elle permet d’étudier des listes complexes de protéines et de mettre en évidence celles spécifiquement influencées par les composés thérapeutiques. De plus, l’intégration de nombreuses informations sur les protéines (domaines, localisations, fonctions…) permet de déchiffrer le mode d’action des composés thérapeutiques.
Grâce à cet outil, les équipes scientifiques d’Inoviem sont capables de communiquer des informations cruciales sur l’identification des cibles thérapeutiques (ou délétères) à leurs clients et ainsi accélérer et sécuriser le développement de nouveaux traitements.
Avant notre intervention, la pile technologique ainsi que les algorithmes employés dans le développement des premières versions d’InOPERA n’étaient plus à la hauteur des sollicitations croissantes d’une activité en pleine expansion. Une telle demande de performances sur une telle base d’information mettait à mal les solutions standards du marché.
Notre expertise a permis d’optimiser InOPERA afin de traiter efficacement un plus grand nombre de données mais également de veiller à une haute qualité de la base de données sous-jacente qui est forte de plusieurs millions d’observations et grandit de plus d'un million d'entrées par an. Le temps machine nécessaire à l’exécution des requêtes a été réduit d’un facteur supérieur à 2000, améliorant de fait le confort des utilisateurs d’InOPERA et la compétitivité d’Inoviem Scientific.
En parallèle, plusieurs manques de la communauté scientifique dans l’analyse des listes de protéines ont été comblés, notamment pour ce qui est de l’analyse d’échantillons animaux non-humains. En effet, le développement de composés thérapeutiques à but vétérinaire se heurte à une absence d’outils disponibles fiables et validés. Les solutions que nous avons pu proposer tendent à combler ce vide et ouvrent également des portes pour une analyse de données indépendantes des informations parfois erronées de la littérature scientifique et vont permettre à Inoviem Scientific de se centrer d’autant plus sur des données expérimentales solides et vérifiées, source inestimable d’information dans l’étude de nouveaux composés.
Enfin, l’esthétique, l’ergonomie et la performance ne sont pas en reste avec de nombreux challenges relevés dans l’affichage et la structuration de l’information, le but étant d’être capable d’analyser, trier, classer et visualiser les grandes collections de données afin d’accéder à une compréhension plus exhaustive de la complexité du vivant. Nous sommes fiers de cette collaboration exigeante repoussant les limites d’une application web experte à haute disponibilité.
Place à 2023 et de nouveaux défis pour ce projet.
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Angélique Quartier
